オートマチック限定免許を持つ者が、ミッション車を運転して警察に捕まったら

オートマチック限定免許を持つ者が、ミッション車を運転して警察に捕まったら無免許運転になるのですか？

条件違反になります。

免許条件違反です。バイクやったら、AT限定の免許持ちの人がMTに乗るのも、同じことが言えます。

中卒程度の知能さえあれば誰でも取れる普通免許すら取れなかった物なんて、この世に存在する価値もない、人類の進化の過程から脱落した下等生物です。
捕獲されて動物園に送り返されるか、猟友会に射殺されます。

ミッションのない車は稀です。
かなり釣れますね。

無免許違反（免許条件等違反）になります。免許証に免許条件等が記載されていますので確認して下さい。

免許条件違反だね。
自動車免許AT車限定ってだけで自動車の免許自体は持っている
でもAT車しか運転してはいけないという縛りを破ったので、免許条件違反