初心者運転者です - 原付免許だけさきにとり2点の違反をしてその後で車の免許を

初心者運転者です
原付免許だけさきにとり
2点の違反をして
その後で車の免許をとり
車で2点の違反を２回しました
そのような時は初心者講習だけですか？

初心者期間中は初心者期間特例の計算方法と通常の累積による計算方法の二本立てになります。
あなたの場合、普通免許で普通車運転中の違反(2点×2)で初心者講習の対象です。
また、累積で6点なので違反者講習か免許停止処分の対象になります。
つまり、ダブルで処分を受けなければなりません。
初心者講習は受けた方がいい。再試験になると免許が無くなる可能性が大きい。

免許は１つ以上あれば、点数部分は共通しています。
新たな免許を取ってもリセットされません。
従って初心者講習の条件は全く変わりません。

原付免許の取得から一年以内でも、普通自動車免許を取得した時点で、原付免許の初心者期間は終わりです。普通自動車免許の取得後に普通自動車の初心者期間が始まり、そこで普通自動車による違反が2点2回なら、普通自動車の初心者講習の対象です。
なお、全ての違反が間に一年間を挟まないなら、累積6点で免停の条件に達しています。まずは「違反者講習」の通知が来るでしょう。