普通自動二輪で質問なんですけどあの免許センターて学科試験受け

普通自動二輪で質問なんですけどあの免許センターて学科試験受ける期限って三カ月なのですか？

学科試験に期限はありませんが、試験場で技能試験を受けて免許を取得する気でいるなら、学科試験の合格の有効期間は6カ月です。それを過ぎても技能試験に合格できないと、学科試験を受け直しになります。
また、指定教習所を卒業した場合、学科試験ではなく技能試験が免除されますが、卒業証明書の有効期間は1年です。
有効期間か「3カ月」なのは、限定解除審査の合格だったかと思います。