四輪の普通免許と二輪免許を持っているのですが、普通免許だけを一

四輪の普通免許と二輪免許を持っているのですが、普通免許だけを一部返納（一部取り消し）することは、可能でしょうか？

申請取消(返納)は、全部でも、一部でもできます。上位だけ残して下位を返納することはできません(例、原付だけ返納して普通自動車を残すことはできない)が、二輪と四輪は上位下位の関係でしありませんので、どちらかを選んで返納することができます。
また、下位免許に「格下げ」することもできます。例えば、所持している二輪免許が大型二輪免許で、普通二輪は持っていない場合でも、普通二輪、あるいは普通二輪の小型限定まで落とす事が可能です。