本免の学科試験は一段階と二段階全てが範囲ですか？ - そうです

本免の学科試験は一段階と二段階全てが範囲ですか？

そうですね。二段階で習った事だけの確認試験ではなく、運転免許を取得できるかどうかの試験ですから、習った事は全て試験の範囲内です。仮免許を取得していても、自身が仮免許の練習で同乗指導者になる場合がありますので、仮免許に関する問題も含みます。

そういう範囲の捉え方では落っこちますよ。
本免の学科試験の範囲は自動二輪から大型貨物までのいわゆる第一種免許のすべてが範囲です。もちろんAT限定とか関係ありません。
なので、例えば「側車付きの自動二輪でブレーキをかけると側車側に曲がろうとする」などという自動二輪の免許を取ろうとする人でさえわからない問題まで出題されます。上記の答えは逆なので×になります。

もちろんその通りです。イラスト問題も出ます。