ディーラーで中古車を購入する際、ディーラーオプションでマフラーを変更したりって

ディーラーで中古車を購入する際、ディーラーオプションでマフラーを変更したりってできますか？

追加費用を払えばできると思います。

在庫があるディーラーオプションならできると思います。

そのディーラーがその車種に適合する新品のマフラーを取り扱っていれば、追加の費用負担で可能でしょう。
例えば、スバルのSTIマフラーなど。
後、ディーラーによっては市販のマフラーブランドのマフラーを取り扱っている所もあります。その場合には購入する中古車に合うマフラーならば追加費用を支払えば変更可能でしょう。例えば、ガナドールなどの製品です。