先に原付免許を持っていましたが、本日普通免許本免試験に合格し、

先に原付免許を持っていましたが、本日普通免許本免試験に合格し、新たに免許発行をしてもらいました。
この際に本免試験の点数が気になり点数がわかるサイトで調べようと思ったのですが原付免
許のときの点数しか出なくて今回の普通免許本免試験の点数の確認が出来ません。
どうすれば普通免許本免試験の点数確認が出来るでしょうか？

下位免許を先にとった場合は新たに番号が割り振られることはないですから諦めたほうがいいです。番号が変わるのは再発行したさいに1回目だと１と着くだけです。あとは何も変わることはないです。

免許もらう時の引換証の下に書いてあったはずですが

免許センターに問い合わせてはいかがでしょうか。
私の県では、本免試験合格後に写真撮影などの資料が渡された際、点数が書かれた紙も貰えました。
都道府県で多少の差はあると思うので、免センに問い合あせた方が確実です。
推測ですが、もしかして不合格者にしか公表していないのでは？
合格者は別にあまり点数を気にしない人もいるでしょうし。
それか、今日の今日だとすぐにデータが更新されいないかもしれないので、日を跨いだら公表されているかもしれないです。

学科試験の点数がわかるサイトってなんだや？
まさか、免許番号で点数がわかるなんて思ってはないですよね？
免許番号で学科試験の点数がわかるなんてのは、都市伝説みたいなものですよ。

「点数がわかるサイトで調べよう」
初耳です。運転免許試験場の学科試験の結果が、ネットで参照できるのですか？。すごい時代になったものですね。
まあ、そのようなサイトがあるとして、しかし、点数のデータがリアルタイムで反映される体制になっていなければ、しばらくはあなたの試験結果が参照できなくても、不思議はないと思います。

点数に関しては免許センターで学科試験合否発表の後に点数が分かるはずです。本官側からの説明がなかった場合聞けば普通に教えてくれます。