運転免許(普通免許)のことで質問させてください免許証の赤い四

運転免許(普通免許)のことで質問させてください
免許証の赤い四角の中に運転できる車種が記載されている欄がありますよね？
先日免許を更新したら「普通」という記載はなく「準中型」「原付」
という文字だけだったのですがこれでいいのでしょうか？
免許の条件という欄には「普通車はAT車に限る」という文あるのでこれでいいと思い帰ってきたのですがどうなのでしょうか？

それでよいのです。
あなたが以前に取得した普通運転免許が、
さらに区分されて「準中型(5トンに限る)」に変わったはずです。
あなたの場合は、AT車限定の運転免許を取得しているようで、
それでよいのでしょう。
以下の警視庁のpdfファイル(ポスター)を見てください。
http://www.keishicho.metro.tokyo.jp/menkyo/menkyo/chugata.files/cyugata.pdf
また、準中型自動車には、AT車限定がないから、
そのように記載しているのでしょう。
http://www.hakunan.com/training-model/jyunchu

「免許証の赤い四角の中に運転できる車種が記載されている欄がありますよね？」
いいえ、ありません。運転免許証にある「種類」の欄は、どの運転免許を所持しているかを記載しています。どの車種を運転できるかを記載している訳ではありません。
「先日免許を更新したら「普通」という記載はなく「準中型」「原付」という文字だけだったのですがこれでいいのでしょうか？」
2017年3月12日施行の道交法改正で準中型自動車免許が新設され、同時に普通自動車免許で運転できる車両の範囲が縮小されました。改正前から普通自動車免許を所持していた人は、その既得権を守るため、施行日に自動的に「5t限定つきの準中型自動車免許」に移行しました。質問者さんの免許証の種類欄は、更新によりそれが反映されたものです。改正前の「普通」と「原付」が、改正後に「準中型」と「原付」に変わったのです。条件欄には、AT限定だけでなく、ほかの文言が増えているはずです。