普通自動車免許の更新で、有効期限が切れていることは知っていたのですが、

普通自動車免許の更新で、有効期限が切れていることは知っていたのですが、去年の１１月ごろからひどいアトピー性皮膚炎に悩みそれ以来、店も休業し（自営業なのですが）、
病院やその他どうしても行かなければならない時以外はほとんど外出しないような生活を最近までおくっていました。 現在は更新しに行ける状態になっているのですが、免許更新についてサイトをみるとやむを得ない理由に、病気、災害等しかかかれておらず、それに入院したことの証明書などが必要だと書かれているのですが、アトピーなどの入院することがあまりない慢性的な病気も該当
しますか？ 有効期限から６か月超え１年未満です。

該当しません。ひどいのでしょうが通用しません。
免許は失効していますが、まだ仮免は発行できるので、実技試験と、自動車学校での取得時講習が必要です。

>その他どうしても行かなければならない時以外
免許の更新はこれに該当するので
そういった時は外出できたということは免許更新はできたと判断します
にも拘らず、行かなかったのでやむを得ない場合には該当しません

>該当しますか？
基本的にしません。
客観的に、更新に行けない程度の重症であるという診断書でも出れば話は別ですが。

それに入院したことの証明書などが必要だと書かれているのですが、
ケース3：予想外！病気やケガで入院！更新期間に手続きできない！
https://gazoo.com/ilovecars/license/140317.html