免許取消後、免許取得のため教習所に通い始めています。 - 学科は

免許取消後、免許取得のため教習所に通い始めています。
学科は免除ですか？と聞かれたのですが
そんな場合もあるのですか？

普通免許や自動二輪免許保持者が他の免許の教習を受けるときは学科が免除されます。(危険予測の学科はありますが)
それと勘違いされたのではないしょうか？

「学科は免除ですか？と聞かれたのですが
そんな場合もあるのですか？」
原付と小型特殊を除いて一種運転免許の学科試験は共通で、いずれかの免許を受けていれば、他の免許の受験時に学科試験は免除されます。そのことを聞かれたのでしょう。「はい」と答えれば運転免許証を見せろと言われる筈です。取消再取得者だとは思わなかったのではないですかね。