免許証を初めて交付される時の順番は、学科の点数の高かった順番ですか？

免許証を初めて交付される時の順番は、学科の点数の高かった順番ですか？
補足受験番号真ん中の方なのに、3番目に呼ばれました

受付番号順です

受験番号とも五十音順とも無関係なでたらめな順番（※）で呼ばれた、とするならば照合、確認ができた順（受付番号順となるべきところが交付申請書の提出タイミングで順番が前後した、確認が必要な箇所がでて照合時間に差が出たなど）ですから完全なアトランダムと考えられます。
そのような場合作業上の都合を最優先した結果の産物ですから並びに法則性はありません。
（※）でたらめな順番とは？
合格者と受験番号の関係を以下とする。
1番 佐藤さん
2番 田中さん
4番 鈴木さん
5番 高橋さん
7番 山田さん
8番 山口さん
10番 中田さん
欠番は不合格者
ここで、似た名前の田中さんと中田さん、山口さんと山田さんの照合に時間がかかったとして
佐藤さん→鈴木さん→高橋さん→田中さん→中田さん→山口さん→山田さん
と呼ばれるようなケースが該当する。

おそらくですが、氏名順ではないですかね。
合格後に交付申請をしますから、試験の点数は関係ありません。
運転免許証の印刷は機械がしますが、印刷された免許証が全部あるかは人間が確認します。ここでもし受験番号でソートされていても、免許証には受験番号は印刷されないので、人間が照合する事はできません。名前なら、人間が探して免許証と照合できます。
そうして名前順に印刷された免許証を、名前順に交付するのだと思いますよ。

受験番号順ですね