自動車免許所持者が普通二輪を教習所に取る際、17コマの実技と1コマ

自動車免許所持者が普通二輪を教習所に取る際、17コマの実技と1コマの学科を行い、卒検を行なって受かればそのまま免許交付という流れであっていますでしょうか？

それで良いと思います。

第１段階 第２段階の見極め卒業検定もすんなり通過した場合
試験場で視力検査をして、併記手続きとなります。
視力検査は試験なので免除にはなりません。

17コマ目で第2段階のみきわめ通ればね
教習所を卒業すれば、免許センターに行って、適性検査と併記手続きで終了です

試験場に行ってそのまま交付だったような。特別何かした覚えはない。

いいえ。卒業検定に受かっても、運転免許試験場に行き、試験を受けて合格しないと、運転免許証の交付（併記）ができません。
試験と言っても、普通自動車免許があれば学科試験は免除になり、指定教習所を卒業していれば技能試験も免除になります。しかし、適性試験は免除にならないので、試験手数料を支払って試験を受ける手続きがあります。交付はその後です。