免許更新の時度ありカラーコンタクト付けてたら写真撮る時は外さないと行けないの

免許更新の時度ありカラーコンタクト付けてたら写真撮る時は外さないと行けないのでしょうか？

写真を撮る時は外さないといけません。撮影時には裸眼で構いません。場所によってはメガネを外して下さいといわれます。
これはストロボがレンズに反射して目元が写らなくなるのを防ぐためです。

適性試験（視力検査）のときはカラコンでもOKですが、写真撮影時はNGです。
なお、免許条件に「眼鏡等」と記載されている場合でも、写真撮影時は裸眼でも大丈夫です。
私自身、眼鏡のレンズが光るので外して撮影しましょう…と言われたこともあります。
適性試験はカラコンで写真撮影は裸眼でOKですから、わざわざ眼鏡を持って行く必要はありません。

間違いなく指摘されます！
メガネ用意して行きましょう！

はい。
免許証自体、ファッション性とは関係ありません。
本人であるかどうかを確認するためにも顔写真があるので。
http://www2.measis.jp/column/entry-373.html

カラーコンタクトは人相を変えるので、人物の特定が目的である運転免許証の写真には使えません。明らかにそうだとわかるものは、写真撮影時に外せと言われますよ。