高校生で車の免許取るときに教習所で「学校で許可取ったか」など聞かれ

高校生で車の免許取るときに教習所で「学校で許可取ったか」など聞かれますか？

教習所によります。

私は学校に隠れて取ろうとしましたが
聞かれて、入校できませんでした。

聞かれるところもあります。
指定の用紙があって、学校の許可したハンコが必要というところもあります。
学校に連絡がいくところもあります。
学校と教習所によって対応が違います。
１８歳となると取れる子と取れない子が出てきますし、そういうのは平等に扱わなければならないので。
教習を受ける事はできても、卒業後でないと免許取得は許可しない。
とか、進学や就職が決まったら教習所に通う許可だす。など
色々です。

まぁ、なんらかの形で聞かれますよ。

聞かない可能性が高いですよ。