免許についての質問です。今、トラクターを乗るために大型特殊免許の教習をしてい

免許についての質問です。
今、トラクターを乗るために大型特殊免許の教習をしています。
その前に普通自動二輪の卒検も終わってあと免許センターに行くだけの状態です。
大型特殊は教習は終
わっていません。
そこで、最初は2ついっぺんに免許登録してもらおうとしてましたが、このコロナの状況でまた免許センターが閉まると思い、普通自動二輪だけでも新規登録しようと思っています。
教習所には、普通自動二輪の登録したと言えば手続きみたいなのをやってくれるのでしょうか？
今までの教習がチャラになることは無いですよね？

心配は要りません。運転免許試験場では、提出された卒業証明書の種類の免許についての手続き「しか」してくれません。普通二輪を先に免許にしてしまいたいなら、そちらの卒業証明書だけ提出すればいいですよ。その後に、大型特殊のコースを卒業してから、改めて併記に行けばいいでしょう。
もっとも、一度に手続きをするなら交付手数料は 2,250円で済みますが、2回に分けたら交付には 4,100円かかることになります(試験手数料はどちらでも同額です)。
ところで「普通二輪を新規登録」と書いていますが、初めての免許取得ですか？。それで普通二輪と大型特殊を並行で履修するなんて、もったいないことをしていますね。どちらかを先に取れば、学科教習の26時間は片方だけで済んだでしょうに。それとも、普通二輪が最初の免許なのではなく、既に普通自動車免許か準中型自動車免許を持っていて、どちらも学科免除で併記をするだけなのでしょうか？。