自動二輪車の免許を持っていたら車の免許を更新するのに午前中で終

自動二輪車の免許を持っていたら車の免許を更新するのに午前中で終わりますか？
神奈川です。

更新の手続きに所持免許の種類は関係ありません。更新時期に来る通知はがきの案内に従いましょう。
おそらく、質問者さんが言いたいのは「普通か大型の自動二輪免許を持っている人が、指定教習所の普通自動車のコースを卒業して、免許証に普通自動車の種類を追加したい場合」のことだと思いますが、それは更新ではなく「併記」と言う手続きです。
この場合、学科試験・技能試験ともに免除になる受験者なので、神奈川県の場合、免許センターでの受付時間は、8:30～9:00 または 13:00～13:30 です。朝に手続きをすれば、交付は午前中ギリギリに終わるでしょうね。