今現在、免許取りたてで緑の免許を所持しています。 - 上位免許を獲

今現在、免許取りたてで緑の免許を所持しています。
上位免許を獲得すると年数に関係なく更新扱いとなり免許の色も青になるそうなのですが、その際に免許センターで写真を撮ることになるのでしょうか？

更新ではなく併記と言います。
免許証が新しくなりますから、写真も新しく撮ります。
上位免許とは、普通自動車免許に対して、中型自動車免許とか、二種普通自動車免許などを言います。
普通自動車免許に対して、二輪免許は上位免許とはなりませんが、やはり普通自動車免許持ちが二輪免許を取得(併記)をすると、免許証が新しくなります。

更新の際は毎回写真撮りますよ

そうです