もう少しで免許を取れる予定なのですが、免許証の写真(化粧の時

もう少しで免許を取れる予定なのですが、免許証の写真(化粧の時)とスッピンの顔が全然違うのですが、車に乗る時は同じ顔(化粧の顔)じゃないとダメというルールはありますか？又埋没を考えてるのですが、整形する前に
撮って閉まったら撮り直さないといけないですか？

同一人物が映ってる限り問題があるとは言えませんが、質問者様は社会生活を送る上で一見して同一人物と判らないような、まるで変装に近いような化粧するんですか？
仮にそうだとしたら、免許証はフルメイクで撮影し、ノーメイクで外出する際は身元を明らかにする必要があるような用向きを足さないと決める必要がありますね。

自分は履歴書の写真は末広二重の時の顔の写真貼りましたが面接受けたときは埋没して目が少し変わってますがなんか変わったねって言わただけでこれ自分ですって言ったらなんてなかったよ

そんなルールはありませんが、当り前の話として、免許証の顔写真と人相に大きな違いがあれば、取り締まり現場で本人かどうかを疑われて困る事になります。そのあたりは自分で調整です。
整形で本人特定が難しくなるなら、整形後に免許証を再交付で作り直しておくのが正解ですよ。

化粧して撮ってすっぴんで乗っても
撮ったあと整形しても大丈夫です