自動車の免許証を更新しました。古い免許証は穴を開けられ返却される

自動車の免許証を更新しました。古い免許証は穴を開けられ返却されるのですが、これは何故でしょうか？
自分は特にメリットを感じませんし、何かに悪用されたり（免許証偽造とか）する可能性が高まるような気がするのですが。。
何かメリットがある方が居るんですかね？

無効となった免許証には返納の義務があり、本来は回収して処分する必要があるものです。ただ、記念に欲しいと言う人が多数居る事や、処分にも手間と費用がかかることから、一律「無効化して渡す」運用で済ませている都道府県もあるようですね。
偽造云々については、別にサンプルとするなら失効免許でなくても巷に溢れているし、運転免許は別に本人確認書類として発行しているものではなく、それを本人確認書類代わりに使うかどうかまで警察が配慮することではありませんから、現に欲しいと言う人に渡している以上、特に気にしない、と言う判断なのでしょう。
私の住む福岡県の場合、前回は更新時講習の最後に「欲しい人は申告してくれ」と言われ、申告した人にだけ穴あけをして返し、申告しなかった人の分は回収していました。ただ、それより前の時はそもそも古い免許を欲しいと言えるタイミング自体がなく、問答無用で回収されていたように記憶しています。

免許センターで回収した無効になった免許証から個人情報が漏れたと言いがかりをつけられないように各自で責任を持って処分するするようにと返される。
個人情報に神経質な人には何かメリットがあるのでしょう。
ちなみに穴空きの免許証は免許証を紛失した時の身分証として使用出来ない。

古い免許証は、記念に取っておきたいという人が多いから返却するんでしょう。穴を空けるのは、更新済みで身分証明能力はありませんという証のためですね。更新ではなく、別の免許を取った場合は、古い方は必ず返納させられますから何か変な感じがしますけどね。
不要なら拾われないように気をつけて捨てればいいだけです。私はいままでに更新した免許証、全部とってありますよ。我ながら若かったなぁと思って見てます。

返さないと廃棄処分費用が掛かるから、それが公安委員会のメリット

古い免許を返却してもらえる免許センターもあるのでしょうか？
質問者さん自身が返却を希望したからではないですか？
一般的には、古い免許は申し出ない限りは回収されるので。