普通免許(AT)を持っている状態から普通免許(MT)を取るこ

普通免許(AT)を持っている状態から普通免許(MT)を取ることは可能なのでしょうか？また可能な場合また1から学科や技能教習を受ける事になるのでしょうか。

ATというのは普通免許の限定条件です。
新規取得ではなく限定解除をすることになります。
学科はなし、技能は4時間と検定を受けて合格すればOKです。
合格後の手続きは都道府県によって異なります。(兵庫県にお住まいなら警察署のみの受付で、試験場・免許センター・更新センターでは受け付けて貰えません。)
試験場でいわゆる飛び入り試験を受けることも可能です。(取得時講習不要)