原付二種は二種免許と関係無いですよね？

原付二種は二種免許と関係無いですよね？

よく勘違いする人が多いようです。
正式には二種原付です。
免許区分は小型自動二輪になります。
黄色、ピンクのナンバープレートが運転可能です。
普通自動車免許のみで運転すると無免許運転になります。
旅客用の二種とは全く関係ありません。

無関係です。
「運転免許の二種」ではなく、「原付の二種」の話です。

では「原付の二種」とは？
「法律上存在しません」とか言う回答者がいますが、ちゃんと存在しており、
道路運送車両法施行規則 第1条第2項 で
「前項に規定する総排気量又は定格出力を有する原動機付自転車のうち、総排気量が0.05L以下又は定格出力が0.6kW以下のものを第一種原動機付自転車とし、【その他のものを第二種原動機付自転車とする】。」
…としっかり定められています。

しかし、道路交通法と道路運送車両法は別もの。
よって「免許の二種」と「原付の二種」の意味は全く違います。

原付2種という免許は存在しません

関係ないです。
原付二種は税金のはなしです。
ピンクナンバーの小型二輪を俗に原付二種と呼びます。(ATとは限らない)
運転免許は普通自動二輪(小型限定含む)又は上位の大型自動二輪免許が必要で、原付免許で運転すると無免許運転となりますが、道路運送車両法では原付になるため高速道路(自動車専用道路及び高速自動車国道)は走行できません。
道路交通法では自動二輪なので二段階右折不要、30キロ制限でない、2人乗り可能となっています。

そもそも原付二種なんてカテゴリーは法律上存在しません。小型自動二輪AT限定免許が正式です。