普通自動車免許を取得してから3年が経過しました。 - 事故歴は無いです

普通自動車免許を取得してから3年が経過しました。
事故歴は無いですが不安でまだ自信がありません。
運転歴3年目なのに初心者マーク付けるのは違反でしょうか？

全く問題ありません。
初心者マークの「義務」は、
「免許取得後1年間以上は付ける（表示する）こと」
だけです。
つまり、運転に自信がないなら、
1年経過後につけていても何ら問題はありません。

運転歴3年目なのに初心者マーク付けるのは違反でしょうか？
なにも問題は発生致しません

違反にはなりません。