普通免許のATの免許を取得するために教習所に通う際に、卒業検定

普通免許のATの免許を取得するために教習所に通う際に、卒業検定では学科試験は行われますか？
また、学校によって学科試験が行われるかが異なるのでしょうか？

学校により効果測定という模擬試験が行われています。
本当の試験は運転免許試験場で行われます。
僻地の場合は教習所に出張してくれるところがあるかも知れません。

質問者様がお通いの教習所を会場にして運転免許試験場が出張学科試験を執り行う…等の特別な環境になければ、卒業後の学科試験は免許を受けようとする者の住所地を受け持つ公安委員会の設置した運転免許試験場にて行われます。

学科試験は警察の試験場で受けます。
多くの教習所では「効果測定」などの名称で学科の模擬試験を卒検までにやっています。

基本行われないと思います。