先日免許停止90日の通知が届いて再来週出頭なのですが、その間スピード

先日免許停止90日の通知が届いて再来週出頭なのですが、その間スピード違反で2点加点されてしまったのですが、この場合120日免停なのでしょうか？
尚前歴1回6点で90日免停です。
それとも90日免停で免停開始からの前歴2の2点で再度免停になるのでしょうか？

90日以上の停止処分には「意見の聴取」の手続きがあり、通知はそれに対して行われます。聴取した意見をもとに処分を決定するんです。
よって、前歴1で6点で90日停止の予定者が「意見の聴取」に呼び出された後、追加で2点の違反をしているなら、意見の聴取のあとに前歴1の累積8点で120日の処分に決定されるでしょう。
これが、30日停止または60日停止の場合は、停止処分の通知が期間明示の上で行われるので、その後に追加で違反をしても、通知した内容で処分をし、追加分の点数が無かったことにされることはあるでしょうけどね。
免停明けは累積0点スタートで、処分前の点数を持ち越すことはありません。ただし、処分前の違反点数を警察側があえて確定させず保留にしておいて、処分が明けてから登録すれば、それは処分後の累積点数に計上されます。通常は人身事故など点数の確定が遅れる場合に取られる措置ですが、警察が意図的にそうして、きちんと漏れなく処分対象にすることもできるでしょう。

速度超過２点の処理が間に合わなかった場合、
９０日免停となり、前歴２累積点数０点で始まる（処理されなかった２点が残ることはない）
速度超過２点の処理が間に合った場合、
免停１２０日となり、前歴２累積点数０点で始まる。