原付の卒業証明と普通免許の卒業証明を本免を取りに行く際に受け

原付の卒業証明と普通免許の卒業証明を本免を取りに行く際に受けて合格したら免許の表記には原付も表記されるのでしょうか？？

先に原付免許を取得してから普通自動車免許を取得すれば原付が表示される。

原付の試験と普通免許は試験が違いますので普通免許試験受けても原付は併記されませんよ、原付記入したいなら原付試験→普通免許試験と受けなければです。

原付は試験場での直接試験のみなので、卒業証明書なんて存在しない

原付に卒業証明書はありませんので、前提が成り立ちません。