現在免許証を紛失しており、再発行しに行こうと思っているのですが、免許不所持

現在免許証を紛失しており、再発行しに行こうと思っているのですが、免許不所持で免許センターに行ったらバレますか？？

ばれますよ。
だって免許証を紛失したから再発行の手続きをしにいくんでしょう？
当然免許センターは免許証の再発行の理由を聞きます。
その段階でばれます。

まあ、バレるかどうかは一旦置いといて、警察とかは自分で運転していくのは避けて、乗せていってもらってください〜とか言うでしょう。
ただ、免停講習などは見られてるしバレますが、再発行手続きの場合は見られてることはないでしょうし、再発行も事務的に行われます。
「今日は車を運転してこられましたか？」
などと聞かれることはないですが、もし聞かれたときは本当の事を行ったほうがいいかもね。

わざわざ自分から話しなきゃバレないよ。免許センター付近の検問でもしバレても免許不携帯だけ。3,000円ね。
その時は運が悪いと諦めて。