今高３で合宿免許に行こうと思っていて、来年からファームステイを1年経験した

今高３で合宿免許に行こうと思っていて、来年からファームステイを1年経験した後に長野県の田舎の家に移住するつもりです。
長野県では軽トラに乗りたく、ファームステイではマニュアルの免許を持っていれば出来ることが広がりそうなのでマニュアルで受講したいのですが、自分は乗り物全般に苦手意識があり、マニュアルで受講するのが不安です。長野だけならオートマでも良いのですがファームステイをするならマニュアルの方が良いですか？また合宿免許でマニュアルは延長になりそうで怖いのですがどうなんでしょう？

延長になるかどうかなんてやってみないと
分からん事ですよ思ったよりうまくいく
可能性も有りますし あまりにも延長ぎみ
なら転校して地元の車校にかようなり方法
有りますよ合宿では延泊になる方が少数です。

ファームステイの行先がアメリカなら、MT車は殆どありませんから、AT限定の免許でも問題はないでしょう。MT車が運転できると知られれば「スティック(MT車)に乗れるのか、すげえ」と言われると思いますが、肝心のMT車が存在しないでしょうからね。
ただ、行先がニュージーランドだと、MT車しか無いケースがままあるので、AT限定付きでは困るかも知れません。
長野の移住後については、今時は軽トラもAT車が殆どなので、古いMT車を使い続けたい事情でもなければ、気にする必要はないと思います。