府中免許試験場から出頭命令がありまして、内容は臨時適性検査だそうです

府中免許試験場から出頭命令がありまして、内容は臨時適性検査だそうです。
精神科医に診断書を書いて貰えば免許取り消しにはならないのですか？

その診断書の内容を基に、貴方に免許を与え続けるか、或いは免許を取り消す又は一定期間停止とするかを公安委員会が判断します。
それが臨時適性検査です。

臨時適性検査というものを受けるわけですから、診断書の有無よりも適性検査の結果次第かと思います。
ただ、病気疾病が原因で運転に支障があると判断された場合、免取りでなく、運転ができるようになるまで免停になるかと思います。
その後、運転ができるまで回復すれば、その期間によっては簡単な試験の後、運転可能になったと思います。
どちらにせよ、臨時適性検査になった流れがわからないので、詳細な回答は難しいですね。