免許センターで仮免許証を紛失しました、どうすればいいですか学科試験を申し込む

免許センターで仮免許証を紛失しました、どうすればいいですか
学科試験を申し込む時、必要書類と一緒に仮免許証が入った封筒も提出してしまいました。
その封筒は返却されず、事務の机に置きっぱなしにされていたのですがそれに気づいたのが免許証と仮免を交換するときだったんです。急いで受付に問い合わせましたが「そういったものは届いていない、落とし物があったら絶対届けられるはず」と返されてしまい、途方にくれています、、、
受付前に仮免許証があることは確認しましたし、確実に免許センターにあるはずなんですが無いと言われてしまったらもうどうしようもなくて、やっぱり諦めて再発行するしかないんですかね？本免許を持った状態で自治体にいえば手続きしてもらえますか？補足厳密にいうと「提出」って形で受理されたわけではないです。
本来なら本免許交付の際に必要な仮免許証を持たずに受け取っているので、二重免許所持になって放っておくと罰則の対象になると言われました。
先に仮免許証を預かっているなら何か一声あるかなと思ったのですが、そうでもないんですかね？

疑問です仮免許証が入った封筒は運転免許センターの窓口に
学科試験の申込書と一緒に提出したと言う事でしょうか？
何が問題なのですか？仮免許証が無くても本免学科試験は
問題無く受ける事ができますが？・・
むしろ仮免許証を返却する手間が省けて良いと思うが？
＞本免許を持った状態で自治体にいえば手続きしてもらえますか？＜
↑↑↑ 無理。理由は仮免許証を交付する必要が無いから。

これは既に解決しているような気がしますが、、、
学科試験申し込む際に返して貰えなかったのではなく、
その時に返納したということなのではないですかね、、、