現在普通免許の方を通っており次卒検という段階なのですが、進学のため県外にでて

現在普通免許の方を通っており次卒検という段階なのですが、進学のため県外にでており車の方は夏帰ったときになる形となるのですが、現在いる県の教習所でバイクを取ろうと考えてるのですが、
夏までバイクの技能だけ受けて夏に無事免許を習得できたら学科の方は途中でも免除になりますか？

免許を持たないあなたが二輪の教習のため、教習所に入所するならば学科教習は免除されません。
先に普通免許を取得する方が良いと思います。

学科の教習は通っている教習所次第ですが，試験は免除になります．