免許証の条件についてですが、普通一種がATで普通二種もAT免許持ちの場合は、

免許証の条件についてですが、普通一種がATで普通二種もAT免許持ちの場合は、免許の条件は，どのように表示されるのでしょうか？

「普通車はAT車に限る」だけでしょうね。
これが、普通一種はAT限定なし、普通二種だけAT限定の場合は「普通車の旅客車はAT車に限る」となるでしょう。一種と二種で条件が違う場合に「旅客車は～」の表現が使われます。

普通車はオートマ車に限る。
旅客車はオートマ車に限る。
または、２つ合わせて、「普通車と旅客車はオートマに限る。」かもな。