本籍地は松戸(千葉)ですが土浦(茨城)に住んでいます。免許取りに行くので

本籍地は松戸(千葉)ですが土浦(茨城)に住んでいます。
免許取りに行くのですが免許センターは茨城県でいのですか？

住民票の住所を管轄する免許センターでしか取得できません。本籍地は関係ありません。

※初めての免許＝住民票がある免許試験場
※既に何か免許を持っている＝住所記載の住所地にある免許試験場

そうですが。

本籍地が松戸（千葉）で、土浦（茨城）に住んでいる場合、運転免許の取得は居住地に基づくため、茨城県の免許センターで手続きを行うことができます。必要な書類や手続きについては、事前に茨城県の免許センターの公式サイトで確認することをお勧めします。

はい、運転免許の手続きは基本的に居住地を管轄する運転免許センターで行います。つまり、あなたの場合は茨城県の運転免許センターで手続きを行うことになります。
・本籍地と居住地が異なる場合、居住地の運転免許センターが手続き窓口となります。
・運転免許の新規取得や更新、住所変更の手続きなどは、居住地の運転免許センターで行う必要があります。