二種免許の問題集の中で「信号機のある踏切で、停止線がない場合の停止位置は

二種免許の問題集の中で「信号機のある踏切で、停止線がない場合の停止位置は踏切の直前である。」とあったのですが問題集の答えは×だったのですがこの場合どこに停止すればいいのでしょうか？

おかしいですね。道交法施行令2条（信号の意味等）の備考には、下記のように書いてあります。
この記載に従えば、『踏切の直前』が正しいです。
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備考 「停止位置」とは、次に掲げる位置（道路標識等による停止線が設けられているときは、その停止線の直前）をいう。
一 交差点（交差点の直近に横断歩道等がある場合においては、その横断歩道等の外側までの道路の部分を含む。以下この表において同じ。）の手前の場所にあつては、交差点の直前
二 交差点以外の場所で横断歩道等又は踏切がある場所にあつては、横断歩道等又は踏切の直前
三 交差点以外の場所で横断歩道、自転車横断帯及び踏切がない場所にあつては、信号機の直前

信号機の直前ですね。
踏切専用信号機がある踏切では
信号が青の場合は一時停止は不要です。信号が赤の場合は信号機の直前
で一時停止をしなければいけません。

信号機の見える範囲で、信号機の直前が停止位置です。
だから×。

道路交通法施行令第2条により、信号機の直前である。

踏切の直前ではなく、
信号機の直前で停止します。