もし、仮に2007年7月に普通免許を取得した人が今年2009年

もし、仮に2007年7月に普通免許を取得した人が今年2009年8月以降に中型免許を取ったとしたら、その後はもう普通二種免許は取れなくなるのでしょうか？

取れます。
二種免許は一種免許を取得して免停期間を除いて３年経過すると受験資格が得られます。
2007年7月に普通免許を取得した場合は、2010年7月以降でないと二種は受けることが出来ません。
2009年8月に取得できるのは一種の中型免許ですね。
※一種の中型免許を取っても普通二種がオマケで付いてくることはありませんww
なお、普通二種を取る前に中型二種または大型二種を取ってしまうと下位免許である普通二種は受験することは出来ません。
制度上では、普通一種から中型や大型を経ないで、いきなり大型二種を取ることも可能ですので。

全く関係ないので問題無く取れますが。が、あと１年待たないと駄目ですね。
２０１０年７月以降なら普通二種取れると思いますが。

取れますが…。何で取れないと思うのか分からない。

普通二種は取得条件が３年以上の取得期間の条件があるので
中型免許を取ってすぐは 普通二種はむずかしいですね
２０１０年８月以降ならOKかもしれませんね。