車の免許を取ろうと考えているところですが、公認自動車学校へ行ったほうが

車の免許を取ろうと考えているところですが、公認自動車学校へ行ったほうがいいのか、非公認自動車学校へ行ったほうがいいのかは迷っています・・・
ネットで見てみたら、公認だと、30万円以上の費用がかかるみたいです。非公認だと、20万円ぐらいで取れそうな感じです。どうしてこんなに差があるのかは良くわかりません・・・良くご存じの方にぜひ詳しく教えて頂きたいです！お願いします。

学生の頃、非公認と公認の違いも調べず非公認にて免許を取得しました(^^;
簡単に違いを･･･
●『実技試験(技能試験)』と『筆記試験(学科)』
どちらの学校でもこの２つの試験は受けなければなりませんが、非公認であれば技能試験も学科試験も運転免許試験場で受験をします。それに対し公認校は技能試験は学校で受験、学科のみ免許試験場での受験となります。（技能試験免除と言う言葉はコレを指します）
どちらで受験しても変わらないでしょ？と思われるかも知れませんが公認校であれば練習で乗りなれたクルマ、走りなれたコース、知っている教官が試験官･･･ですが、免許試験場であれば試験場が用意する検定車（車種も試験日によって違う）、初めて走る試験場、試験官は警察官（警察職員）です。試験場の試験は採点も厳しく簡単にＯＫは貰えません(^^;
●教え方もまるで違う
公認校は学校の授業の様に実技も学科もカリキュラムに沿った段階的な教え方をします、言い方は悪いかも知れませんが授業を受けてハンコを集めればちゃんと免許が貰えます。それに対し非公認校はカリキュラムなど無くとにかく運転出来るようになれば良い･･･と言うような教え方をします。私も初日からクルマに乗せられ、ひたすらコースを周回。時には教官すら乗らず｢お前らちょっと走ってこい！｣と好き勝手に教習車を運転させて貰ったこともあります(^^;
学科に至っては暇つぶし程度にビデオを見せられ、試験の過去問を一夜漬けして終わりでした（受かりましたけど）。
確かに公認は高いですが通っていれば必ず免許は貰えます。非公認は安いですが免許試験場で合格しない限り免許は貰えません、試験に落ちれば追加料金も掛かりますので結果として公認より高くなるケースも多々あります。
運転が大好きでお金と時間に余裕のある人や腕に自信のある人には非公認をお勧めしますが、堅実に免許を取得したいのであれば素直に公認校へ行きましょう（ｗ
蛇足：2年前、趣味が高じて大型2種免許を取得しましたがその時は失敗は許されない環境でしたので大人しく公認校へ通いました。個人的には非公認校へ通った経験は良い思い出なんですけどね(^^)

質問の内容をみると、「公認」と「非公認」であれば、もちろん「公認」のほうがいいが費用は「非公認」のほうが安い、といったところで、yanyanandoさん が公認か非公認にするか迷っている理由は「費用」の面と認識して回答いたします。
公認に通ったほうが技能試験を試験場で受けなくてもよくなり、免許取得者の９７％がいわゆる「公認」の教習所卒業者です。
運転免許試験新規合格者に占める指定自動車教習所卒業者の割合
31ページ目に割合が載っています（９７％が指定教習所卒業者）
http://www.npa.go.jp/toukei/menkyo/menkyo12/h20_main.pdf
また、ＭＴ車の講習は無駄に難 しいです。エンジン始動時のエンスト、ギア変速がスムーズにいくかどうか、など、教官に言いがかりをつけられる場面がＡＴ車より多いです。
私自身の経験で言うと、「ギアの変則がスムーズではない」という理由で落とされたり、減点されたりして余計にお金を払った経験があります。
新しく発売される車（一般的な乗用車）はＡＴ車が９０％以上で、ＭＴ車は市場から消えつつあるのが現状です。
ＡＴ車とＭＴ車の販売比率
http://kuruma.cside.com/yomimono/mt.html
仕事などでＭＴ車を運転する必要がある場合には、講習×4時間＋卒業検定を受ければ簡単に切り替えが出来ますので、ＡＴ車で十分に運転の感覚をつかんでからのＭＴ免許取得で遅くないと思います。
http://kuruma.cside.com/yomimono/mt.html
日本の運転免許の取得費用は世界一高額です
教習所料金の国際比較
http://www.web-pbi.com/license.htm

私は現在の免許行政と警察利権を疑問に思い、腹立たしく思っているのですが、
現在の限られた条件の中で、質問者さんが最大限に要領よく免許を取得されることを願います。

教習所の選択について詳しくは私の過去の回答例を見ていだだけると幸いです＾＾

公認自動車学校は卒業までのカリキュラムが決まっています。
試験場での仮免実地試験に当たる修了検定・仮免学科試験・試験場での本試験実地試験に当たる卒業検定までを公認自動車学校で受ける事が出来て卒業すれば１年間は試験場での実地試験が免除になって、試験場の学科試験・視力等の適性検査に合格すれば免許証が交付されます。
非公認自動車学校はカリキュラムは決まっていません。
仮免学科試験・仮免実地試験・本試験学科試験・本試験実地試験などの全ての試験（視力等の適性検査も含みます）を試験場で受験し、本試験実地試験合格後に指定教習所で取得時講習を受講して免許証が交付されます。

>良くわかりません
この時点で「公認」に行くべきです。自己完結出来ない貴方が非公認に行ってもメリットは薄いです。

公認は卒業すれば、学科試験に受かれば免許を習得できますけど、
非公認は卒業してから、技能試験、学科試験両方受からなければいけません。
したがって非公認は免許を必ず習得できるわけではないからです。
ようするにただの練習場です。

まぁ～非公認でなんども落ちて高くつくのも良い経験になると思いますよ。（笑）