私は普通車と、「普通自動二輪」の運転免許証を持っていました。大型特殊

私は普通車と、「普通自動二輪」の運転免許証を持っていました。大型特殊（農耕車に限る）の取得により、書き換えをしたところ、バイクの免許が「大型自動二輪」に変わっていました。これは、警察の間違いですか？

これは多分、間違いでしょう。
早めに申し出することをお勧めします。
（このままにしておき、後々やっかいなことになってもいけませんので）

もしそれが間違いなら、すみやかに試験場で訂正してもらいましょう。
そのまま知らんぷりで大型二輪なんか乗って、違反して免許証照会
した時に普通二輪しかないってバレた日にゃ、無免許運転でっせ。