免許の初心者運転期間について。普通自動車免許を取得後一年以上経っている前提

免許の初心者運転期間について。
普通自動車免許を取得後一年以上経っている前提で、普通自動二輪車を新規に取得した場合、免許の色は青/金から緑になるのですか？

いいえ。免許証の帯色は、免許の種類ごとに決めている訳ではありません。最初にいずれかの種類の免許を取得した日を起算日に、免許歴と違反歴で決まるものです。
普通二輪を併記する際に、ゴールド免許の要件を満たしていればゴールドになり、そうでなければブルーになります。グリーンに戻ることはありません。