AT車限定の自動車免許を持ってる方が、マニュアル免許を取得するには、どうす

AT車限定の自動車免許を持ってる方が、マニュアル免許を取得するには、どうすればよいのですか？
やはり1から教習所で習うのですか？

「限定解除」になります。
教習所で、「AT限定の限定解除」の教習を4時限受けて、限定解除審査(技能試験)をして、合格して、免許センターで手続きすれば、免許証の裏に「限定解除」と書かれます。
限定解除は、教習も試験も教習所のコース内で行いますので、路上に出ることはありません。

免許証は交付されずに、今持っている免許証の裏面に書かれるだけです。
次回の免許更新の時に、表面の条件等からAT限定が消えます。

多分、技能検定に合格すれまいいのでは...。
教習所は行かないといけませんが、交通ルールなどは、ＡＴ限定車とは変わりないので、免許持ってる上でマニュアル車をということなら、車の操作方法がメインになると思いますよ。

ネットでは「限定解除教習」を受けないといけないようです。
http://paperstreet.iobb.net/license/atkaijyo/atkaijyo.htm
限定解除教習で検索すると色々出てきましたよ。

教習所でできますよ。
限定解除教習は4時限+限定解除審査（卒業検定と同じ）
審査合格したら、その後運転免許試験場に行き、免許証の書き換えで終わり。