本籍地を変更したのですが、運転免許を更新するときに、本籍地を変更するのを忘

本籍地を変更したのですが、運転免許を更新するときに、本籍地を変更するのを忘れておりました。
運転免許の本籍地を変更していないとどういう困ったことがありますか。

特に困ることは無いのですが、届出は義務ですから、最寄りの管轄の警察署で変更しましょう。
本籍地の載った住民票があればできますよ。
http://www.unten-menkyo.com/2008/07/post_6.html

一応は届出項目不備と言う事で発覚すればそれなりの注意は受けるでしょうが、本籍が表面に記載されていない現在の免許証では何の支障も無いと思います。