普通自動車免許の取得について質問です。普通自動車免許の学科試験

普通自動車免許の取得について質問です。
普通自動車免許の学科試験に落ちてしまって、また申請書を作成するために 写真を撮った(自分で証明写真のような機械で）のですが、眼鏡をしたまま撮ってしまいました。

普段から眼鏡ですし、運転するときも眼鏡をもちろんかけるのですが、教習所で撮った写真は眼鏡をかけずに撮っています。
眼鏡をかけたままの写真ではまずいでしょうか？
回答よろしくお願いします。

何ら問題ありません。
撮影時のフラッシュがレンズに反射して、目が写っていないのなら証明写真としては不適切なものになりますが。
証明写真とは見た目で人物を特定または照合するものですからね。
ちなみに眼鏡等の条件を付される場合でも、眼鏡を外した状態の免許証写真を撮影することも禁止されていません。
(コンタクトレンズを使用する人は眼鏡をかけませんよね)

条件に眼鏡等がはいるため、
お洒落眼鏡でないならもんだいはない。
裸眼で視力審査をパスできるなら、問題あり。

二種免許の申請したときには、私はメガネをかけたままでの写真でしたが、別に何もいわれませんでしたけどねえ。都道府県により、差異があるかもしれませんから、試験場で確認して下さい。