運転免許証を紛失して門真の運転免許証センターで再発行してから

運転免許証を紛失して門真の運転免許証センターで再発行してから、警察に紛失届を出しました。運送会社で働いているので、翌日に会社に報告しましたが、上司から指摘があり、紛失届を出してから、免許証再発行しろと
言われました。上司からいつ頃に紛失したかを話しました。友達と外食してる時から自宅に帰社した時の間になくしたと言いました。
上司が「会社に友人を連れてこい、取り調べしたいから」と言われました。会社の上司が私の友人を会社に連れてきて、取り調べをするには問題はありますか？

まったく問題ありませんよ

要するに上司の方はその友人が盗んだと疑ってるんでしょう。酷い話です。
免許証があれば仕事にも差し支えないはずですので取り調べなんてあり得ません。そして、手順は違えど再発行したのですからもう済んだ話です。

その上司はどんな法的根拠で質問者様の友人を取り調べるなどといってるのでしょうねぇ・・・
完全に人権侵害ですねぇ、取り調べをする（正確には取り調べ類似行為）という理由で会社の一室などでおこなえば、逮捕、監禁罪でその上司が罪に問われますね。
それに、免許証を紛失したのは質問者様の過失であって友人には何の関係も責任も無いですよね。
まぁ、呼び出されたところで、質問者様の友人には応じる義務はありませんかねぇ・・・
もし、私なら呼び出されたところで行きませんがね。

再発行すれば、別に紛失届もなんもいらん。
再発行した時点で免許証番号も変わるんだし。

確かに順序としては落し物の届けが出ている可能性
及び、取得した第三者が悪用する可能性があるため
警察に紛失届を出す。
その後、運転免許証センターで再発行が正しいでしょうね。
しかし取り調べってなんで？？
上司は警察官？？ 何様？？

問題はありませんが、言い方には注意が必要ですね。
その言葉をそのまま友人に伝えたら『何様？』と思うでしょう。それに、連れてくるのも任意なので友人が拒否する事も可能です。