東京で一人暮らしを始めたため - 消印付きのハガキを警察署に持って

東京で一人暮らしを始めたため
消印付きのハガキを警察署に持って行き
免許証の住所をそこにしました。
しかし住民票は千葉の実家のままです。
新しく普通二輪を東京の教習所で取ったので
更新のため免許センターに行きたいと思っています。
ややこしい話になりますが、その教習所の卒業証明書には千葉の住所が明記されてしまっています。(免許の住所変更する前に通いはじめたため)

この場合どちらの免許センターに行くべきでしょうか？
訳あって住民票はなるべく移したくありません。
わがままな質問で申し訳ありませんが
回答頂ければ幸いです

~都内に3箇所ある運転免許試験場のいずれかで、併記の手続きを行ってください。
既に運転免許を所持している人は、運転免許証の住所地を管轄する運転免許試験場で運転免許試験を受ける（試験免除も同じ）ことになり、住民登録がどこにあるかは関係ありません。
質問者さんの運転免許証住所は都内ですから、都内の府中、鮫洲、江東のいずれかの運転免許試験場で併記を行ってください。
http://www.keishicho.metro.tokyo.jp/menkyo/menkyo/tetuzuki/tetuzuki03.htm
教習所の卒業証明書は卒業検定に合格した時点の住所で発行されますから、運転免許証の住所を変更した時点でその旨を申告していれば、東京の住所で卒業証明書は発行されていました。
ただ、卒業証明書の住所が運転免許証の住所と異なる千葉県になっていても支障はありませんから、そのまま手続きに行ってください。

「訳あって住民票はなるべく移したくありません。」・・・訳は如何でも良い、運転免許の管理は都道府県単位の仕事なので、当然、千葉で免許を取得する事。
東京と千葉は近いので、面倒でも日帰りで行ける距離です。

行きたい方にTELして聞いてみましょう。