普通自動車免許を所持してます。それで先日大型バイクの免許を教習所でと

普通自動車免許を所持してます。それで先日大型バイクの免許を教習所でとりました。
そのため巣鴨の免許センターで書き換え？をしなければならないのですが日曜日できますか？

新たな免許の種類を追加することを、「併記」と言います。
併記は、手続き上は「学科と技能が免除の試験」という位置づけです。
そのため、埼玉県警察のホームページで確認するときも、
「受験手続」のところを見なければいけません。

運転免許センター1階(試験棟)8番・9番カウンター
月曜日から金曜日の平日午後1時00分から午後1時45分(45分間)が受付時間のようです。
祝日・休日・年末年始は、やっていません。
http://www.police.pref.saitama.lg.jp/f0130/menkyo/siteisotu-nirin.html

流れが自動車免許の時と同じで学科が免除なので学科の時間はボートしてるだけで平日しか試験が無いので同様に平日しかできません

Ｑ：そのため巣鴨の免許センターで書き換え？をしなければならないのですが日曜日できますか？
Ａ：巣鴨にはそもそも運転免許センターは存在しません。
ですのでどこの運転免許センターかは不明ですが基本的に併記（書き換え×）手続は平日しか業務を行っていません。

巣鴨の免許センターとは？
もしかして鴻巣にある「埼玉県警運転免許センター」
のことでしょうか？

免許センターへ直接問い合わせた方が確実ですよ。
基本的には、日曜は免許の更新業務だけですので対応していないはずです。