原付免許の初回更新について高校生の頃に原付免許を取得し、もうすぐで更新

原付免許の初回更新について
高校生の頃に原付免許を取得し、もうすぐで更新の期限が切れてしまうので更新するか迷っています。
もう原付には乗らないし夏休みに車の免許を取る予定です。
近所で更新しようとすると平日しか対応していないのでするとしたら2時間程かかる免許センターまでいかなくてはいけません。
この場合、免許を更新しておくとなんらかのメリットはあるのでしょうか？

メリットになるかどうかですが、身分証明書として
有効なものになるかと。

個人的には更新した方が良いと思います。
更新した場合
・普通自動車免許証を取得したら（既に免許証を持っている人が違う免許証を追加する事を「併記する」といいますけど）免許証の色はブルーになる。（今はグリーンの免許証を持っていますよね。）
・普通自動車免許証を併記した新しい免許証が更新を迎えた時、無事故無違反ならゴールド免許証になる。（その時の講習時間は３０分）

更新しない場合、免許証の失効中になり普通免許を取る時に、失効中の免許が邪魔になると思いますよ。
たったの２時間程度でどうこう考えるなら、普通免許もあきらめたほうが良いと思いますね。

免許証の色がブルーになる。
（普通免許取得してもブルー）
更新せず失効すれば、
普通免許とったときグリーン
違反がなければ、早くゴールド免許になる。
普通免許の試験を受けるとき、
住民票を出さなくて済む。

住民票等の書類を用意する必要が無くなります。
あなたの地域の役所が土日でも対応していればよいですが、一般的には平日に行くことになりますので、免許を更新しておいた方が楽かと思います。

また、免許証に「原付」という表記が有るかと思いますが、原付免許を失効させてから普通自動車免許を取得した場合には「原付」という表記が無くなります。
これは原付を運転できなくなるわけではありません、表記上の問題です。
原付免許を更新していれば「原付」「普通」と記載されます。