現在普通自動車MT免許普通二輪AT免許小型二輪MT免許を持っていま

現在普通自動車MT免許
普通二輪AT免許
小型二輪MT免許を持っています。
普通二輪MT免許に限定解除するとしたらどういった講習になるのでしょうか？

講習はありません。
限定解除審査をうけます。
教習所を利用する場合、
普通自動二輪MT車で数時間教習をうけ審査をうけます。
しかし、小型でATじゃなかったのに
普通自動二輪AT限定にするって珍しいね^^;
変速操作に問題がなければ、
MTのほうがATより簡単だよ

＞小型二輪MT免許
そういう免許(枠)はないと思います
ご自身の免許証をご確認ください ｢持っていれば｣ね....

CB400SF-Kという教習車で教習を３時限受けて技能審査（いわゆる卒検と内容は全く同じです）に合格するだけですm(_ _)m
3時限しかありませんので補習にならないよう頑張って下さい。

講習なんて有りません