本免を取りに自動車学校に行ったのですが、色弱とつげられ学科を受けることもできず

本免を取りに自動車学校に行ったのですが、色弱とつげられ学科を受けることもできず帰されました。
卒業検定まで運転していて信号を見間違えることは一度もありませんでした。
赤色の判別が
できていないといわれ帰らされました。

色彩の検査方法は二色づつ色のついた光？を見せられて何色か答えるものでした。

どうにか免許を取る方法はないでしょうか？

運転免許試験場（運転免許センター）へ本免学科試験を受けに行った際、適性試験に合格できなかったということでしょうか？
教習所へ入所をする際にも色覚検査は実施されますので、どうして何事もなく入所ができたのか疑問はあるのですが、信号機の色の判別ができるなら、免許は取得できるはずですよ。
ただし、「どうにか免許を取る方法」というものはなく、運転免許試験場での色覚検査に合格するしかありません。
色覚については赤、黄、青の判別ができればよく、検査方法は色々あり、特定の検査に合格できなければダメというものではありませんから、運転免許試験場の適性相談窓口を訪ねて、詳しく検査をしてもらうようにしてください。
https://www.npa.go.jp/annai/license_renewal/madogutiitirann.pdf
なお、予約が必要なところもありますから、あらかじめ電話をするようにしてください。
信号機が何色なのかを判別出来さえすればよいので、試験コースに設置されている信号機を実際に使って検査をすることもあるようです。

確かに免許も必要ではありますけど・・・
自動車学校に支払ったお金は返金して貰いましたか？
普通であれば、入校時点で確認することですね。
免許センターに問い合わせて、免許を取得可能か確認して貰うと良いと思います。
最寄りの警察署でも対応してくれるかも知れません。
免許センターか警察で不可能と言われた場合は残念ですが諦めて下さい。
大丈夫と言われた場合は、自動車学校に「警察（免許センター）で免許取得は出来ると言われた」と伝えれば対応してくるはずです。
書類のような物を出して貰えると確実ですね、それか対応した担当者の名前をきろくしておくなどですね。