仮免許と本免学科を受かっているのですが、 - 仮免入校した場合、

仮免許と本免学科を受かっているのですが、
仮免入校した場合、学科免除となり学科代を差し引く事はありますか？

一般試験をあきらめて、自動車学校に途中入校をする場合でも、学科教習を受ける事になります。
効果測定は免除になるかもしれません。
卒業すれば、本免学科は免除になります。
大一段階がないので、その分は安くなるかと思いますが、第二段階の分が安くなることはないでしょう。具体的には自動車学校にお尋ねを。

意味が分からないです。
本試験合格されているのですか？
免許貰ってるのでしたら、無理です。
本試験合格されているのでしたら、
仮免許証は、試験場に渡してあると思いますけど。

仮免所持での入校は第二段階からのスタートです。
技能１９時限と学科１６時限です。
本免学科を合格しても上記の時限数を受講しないとダメですし
費用も仮免持ちだけの人と同じです。
仮免の期限が迫ってると入校をお断りされる場合があるので注意を

仮免入学の場合は、二段階からスタートとなるので
実技と学科が一段階のものは免除され
その分安くなります。