中古車でサイトに記載の支払い総額より高い見積金額が提示されるのは

中古車でサイトに記載の支払い総額より高い見積金額が提示されるのは何故なのでしょうか？

よくあることですね、見せかけの金額を提示して、そこに販売店側の諸費用手数料を後々足していくことが特に相場より安いと思ってのぞいてみると金額が後々上乗せされることが多々あります。
安く見せておけばその分お客は寄ってくるので、そういうしょうもない商売をしてるってことになります。

法的にはサイトやプライスボードと異なる内容で見積もりを出しても問題ないですからね。
販売店としては、客寄せに為に他社よりも高いと思われる金額では宣伝になりませんので、サイトやプライスボードでは、最低限での金額を表示します。
ですが、実際の取引では、出来る限り利益の上がる形で売りたいので、色々と盛り込む訳です。
序に言うと、サイトやプライスボードで示した金額で販売できないのは違反となっていますが、他に条件が良い客の引合が合ったので断ったと言う話では違反になりませんので、大手は今でもオプションてんこ盛りでないと売れないと言ってますね。

見積には大抵コーティングとか有料長期保証とか、お勧めのオプションを入れてくるからです。要らなかったら断ればいいだけです。
何か強引にというか、ほぼ強制的にオプション込みで契約させようとする大手があるようですが、そういうのは消費者センターに通報してやればいいです。