免許証を定期ケースに入れて改札を通るとエラーになったり、免許証のIC

免許証を定期ケースに入れて改札を通るとエラーになったり、免許証のICに不具合が起きたりしますか？

機械側でのエラーになる可能性はあります。
個人的な経験ではエラーになった事は１度もありません。改札口だけではなく、社内の免許証チェック機器のにSuicaも入ったケースを翳してますが、１度もエラーになった事はありません。。

機械の中で詰まってしまいますよ。

私の場合、ほぼ問題無しです。
年に１度程改札機でエラーが起きますが、再タッチでokとなります。
このエラーが免許証を一緒に入れていたせいかは不明(スイカ単体でもエラーが有る)です。

回答は既に出てますが、免許証を財布や金品と一緒に
保管してると、スリは100％確実だが、落とした時にも
戻って来ない可能性が大。
現金、各種カードと共に免許証も闇の中。
当然ですが、再発行するまで運転も出来なくなります。

最近主流のICカードは非接触式です、これらのICカードは内部に電源を持たないので、ゲート機器から電磁波を照射し、それをカード内蔵のコイルで受けて電力を起こし、その電力でICを動作させてゲート機器に「応答」をする仕組みです。日本の運転免許証も、このICカードの一種です。
複数のICカードを束ねた状態でゲート機器に接近すると、個々のICカードが全て同時に起動します。カード側で「この機器は自分とは関係ない」と判断して応答を返さないようにするのは、相互運用が普通に行われる現在では仕組み的に無理がありますので、有効無効に関係なく応答を返してしまいます。その結果、機器側でどのICカードが通過しようとしているのかが判別できなくなり、正常な通信が行われずにエラーとなってしまいます。
ただし、不具合が起きるのはゲート機器側だけで、カード自体に何らかのトラブルが起こる訳ではありません。

少なくても、改札口のエラーの原因にはなります。