現在自動車学校に通っているのですが免許制度が変わる3/12まで

現在自動車学校に通っているのですが免許制度が変わる3/12までに免許センターで免許を取得しないと全てが無駄になるということなのでしょうか？

無駄にはなりませんが、３月１２日から普通免許を同じ苦労して取得しても乗ることができる大きさの免許が少し小さくなるだけです。３月１１日までに試験場で合格できればちょっとお得だということです。
自動車学校の卒業自体は一年間有効です。

将来的に、乗用車かせいぜい小型貨物（ライトバン程度）しか乗らないつもりなら、大丈夫です。
もちろん、改正後の普通免許でも持っていれば、今後のステップアップはしやすくなります。

無駄にはならないよ。
ただ乗られる車の範囲が狭くなるだけ。